Jefferson Farfán entró al club de los 100 con camiseta de Alianza Lima. El atacante ingresó en la parte final del duelo ante César Vallejo y con ello sumó un centenar de duelos vestido de blanquiazul.
Jefferson Farfán debutó con camiseta de Alianza Lima en 2001. Fue campeón nacional en esa temporada, en 2003 y se marchó a mitad de 2004. Este año volvió al equipo de sus amores.
Con la camiseta de Alianza Lima, Jefferson Farfán ha sumado 35 goles, recibió 16 tajetas amarillas y una roja.